Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01678 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P01678 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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P01678 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01678 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01678 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01678 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms