Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01662 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01662 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01662 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01662 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01662 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms