Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01661 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01661 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01661 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01661 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01661 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01661 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01661 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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