Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01656 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01656 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01656 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01656 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms