Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01654 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01654 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01654 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01654 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms