Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01650 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01650 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01650 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01650 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01650 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01650 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01650 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01650 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01650 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms