Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01647 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01647 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01647 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01647 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01647 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01647 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01647 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01647 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms