Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms