Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sp1O89090 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms