Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnkO88874 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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