Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms