Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CntfrO88507 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms