Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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