Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp4O70480 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms