Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxq1O70220 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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