Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrxO55103 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrxO55103 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrxO55103 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms