Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms