Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn5O54942 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn5O54942 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn5O54942 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn5O54942 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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