Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms