Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek2O35942 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek2O35942 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms