Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sp100O35892 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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