Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf18O35714 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms