Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Lhx8O35652 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lhx8O35652 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Lhx8O35652 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Lhx8O35652 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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