Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc1a6O35544 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc1a6O35544 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc1a6O35544 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc1a6O35544 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc1a6O35544 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc1a6O35544 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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