Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clk3O35492 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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