Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TnxbO35452 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TnxbO35452 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms