Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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