Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrt1O35449 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms