Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkd2O35245 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2O35245 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms