Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nedd9O35177 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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