Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms