Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sypl1O09117 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl1O09117 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms