Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckarO08786 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckarO08786 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CckarO08786 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CckarO08786 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CckarO08786 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms