Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sema3aO08665 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms