Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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MttpO08601 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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MttpO08601 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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MttpO08601 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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MttpO08601 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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MttpO08601 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MttpO08601 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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MttpO08601 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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MttpO08601 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MttpO08601 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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MttpO08601 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms