Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp35M0QWN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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