Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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