Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm2888K7N746 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm2888K7N746 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2888K7N746 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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