Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3402K7N5P2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms