Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms