Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5294J3QP53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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