Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20795J3QP49 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms