Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms