Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm6408J3QNG1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm6408J3QNG1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm6408J3QNG1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm6408J3QNG1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm6408J3QNG1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6408J3QNG1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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