Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc180J3QNE4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms