Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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