Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20873J3QMQ9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms