Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem200cJ3QK46 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms