Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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