Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms